根據(jù)來自全球119位微生物學家支持的一項新的共識聲明,為細菌和古細菌分配科學名稱的長期規(guī)則已經(jīng)過期。
細菌和古細菌(缺乏細胞核的單細胞生物)構成了地球上三個生命域中的兩個,并根據(jù)國際原核生物命名法(ICNP;該法典)進行命名。目前,該規(guī)范僅識別可以從實驗室文化中培育出來的物種-對于研究野外細菌和古細菌的微生物學家而言,這一要求長期以來一直是個難題。
自1980年代以來,微生物學家一直使用遺傳測序技術從環(huán)境中直接采樣和研究微生物的DNA,這些環(huán)境遍及從地球冰冷的海洋到深層地下礦山再到人類皮膚表面的各種生境。對于這些物種中的絕大多數(shù),尚無在實驗室中進行培養(yǎng)的方法,因此,根據(jù)《守則》,不能正式命名它們。
艾莉森·默里(Alison Murray)表示:“近年來,從環(huán)境中收集的古細菌和細菌的基于基因組的發(fā)現(xiàn)激增,但沒有正式的系統(tǒng)對其正式命名,這在該領域造成了很多混亂和混亂。”里諾沙漠研究所(DRI)生物學博士,博士。“能夠用一種共同的語言來代表其基因組序列所知的未耕種生物的多樣性非常重要。”
在本周發(fā)表在《自然微生物學》雜志上的一篇文章中,穆雷和她的合作者介紹了更新有關命名細菌和古細菌新物種的現(xiàn)有法規(guī)的理由,并提出了兩種可能的發(fā)展途徑。
作為第一種選擇,該小組提議正式修訂該規(guī)范,以包括以DNA序列信息表示的未培養(yǎng)細菌和古細菌,以代替當前所需的活培養(yǎng)物樣品。作為替代方案,他們建議為未栽培的生物創(chuàng)建一個完全獨立的命名系統(tǒng),該體系可以在將來的某個時候與《守則》合并。
內(nèi)華達大學拉斯維加斯分校生命科學教授Brian Hedlund博士說:“對于這一領域的研究人員而言,采用上述兩種方法中的任何一種都會帶來巨大的好處。”“我們將能夠創(chuàng)建一個統(tǒng)一列表,列出過去幾十年來發(fā)現(xiàn)的所有未栽培物種,并為如何命名新物種以及何時命名實施普遍質(zhì)量標準。”
例如,使用DNA測序研究人類微生物組的研究人員,即生活在體內(nèi)和人體上的成千上萬種細菌和古細菌,將有一種方法為他們確定的尚未代表的物種分配正式名稱。在文化收藏中。這將提高世界范圍內(nèi)的研究人員就諸如不同人群的飲食與腸道細菌之間的聯(lián)系等主題開展協(xié)作研究的能力,或者以先前的研究為基礎。
波特蘭生物學教授Anna-Louise Reysenbach博士說:“它為提供一種結構化的方法,為在科學界內(nèi)部和整個公共領域交流微生物世界中尚未開發(fā)的廣闊生物多樣性奠定了基礎。”州立大學。“這就是為什么這種變化如此重要的原因。”
本文和擬議的計劃是由美國國家科學基金會資助的一系列研討會的最終成果。默里說,下一步是找出實施戰(zhàn)略,以推進兩個擬議計劃中的一個,同時讓許多為這一共識聲明做出貢獻的微生物學家以及世界各地希望幫助實現(xiàn)這一改變的其他人參與進來。到目前為止,許多人都渴望參加。
穆雷說:“這是一個令人興奮的領域,因為我們正在描述地球上的生物多樣性并發(fā)現(xiàn)新的門,就像科學家回到1800年代時仍在發(fā)現(xiàn)更大的生物一樣。”“許多范式一直在改變我們對世界運作方式的理解以及那里存在多少多樣性-這是需要做出的另一種改變。我們將需要改變它,否則我們將要改變。生活在混亂中。”