在許多生物中，RNA介導的染色質調節(jié)是基因表達的核心，但迄今為止，人們對RNA調節(jié)DNA染色質包裝并由此打開和關閉基因的機制的了解仍然很少。

但是，Caroline Dean教授實驗室的方曉峰博士的新論文已經能夠證明形成染色質的蛋白質與RNA處理機制之間的物理相互作用。這確定了反義RNA的加工如何影響染色質狀態(tài)并定量調節(jié)擬南芥FLC基因座的表達。

該小組使用了一種稱為交聯核免疫沉淀和質譜分析(CLNIP-MS)的方法，該方法先前是由該小組與約翰·英內斯中心蛋白質組學小組的蛋白質專家共同開發(fā)的，該方法使用甲醛捕獲植物中蛋白質的相互作用，否則會太短暫而無法學習。

在論文中，研究人員詳細介紹了反義RNA COOLAIR如何與進行RNA加工的3'RNA加工因子結合。研究小組隨后證明了這些3'RNA加工因子與改變染色質結構的蛋白質動態(tài)結合，稱為FLD / LD / SD626，并且這種復合物共同阻礙了基因被開啟的能力。

主要作者馮曉峰博士解釋道;“這項工作是全面了解RNA介導的染色質沉默的重要一步。我們已經能夠將RNA加工因子與染色質修飾劑進行機械連接。”

這些新近定義的物理聯系導致染色質變化，從而關閉了FLC(調控開花的關鍵基因)。如果去除了3'加工因子或染色質修飾劑，則基因被打開。

有趣的是，盡管酵母中確切的等效機制仍然未知，但該過程顯示出與酵母中的基因調控相似。表觀遺傳機制的保守性意味著這項工作與理解基因在所有生物體中如何開啟和關閉有關。