盡管最近有醫(yī)學(xué)上的進(jìn)步,癌癥仍然是全世界死亡的主要原因之一。超過90%的與癌癥相關(guān)的死亡是由于轉(zhuǎn)移而不是原發(fā)癌的增長(zhǎng)。當(dāng)癌細(xì)胞擴(kuò)散到人體的新區(qū)域而逃避人體免疫系統(tǒng)時(shí),就會(huì)發(fā)生這種轉(zhuǎn)移。
由于臨床前成像技術(shù)(例如生物發(fā)光成像和MRI)的分辨率有限,因此無(wú)法全面檢測(cè)模型動(dòng)物體內(nèi)小的轉(zhuǎn)移灶。這些缺點(diǎn)通過評(píng)估新藥候選藥物的功效嚴(yán)重地阻礙了有效療法的發(fā)展,并導(dǎo)致對(duì)各種癌癥類型的傳播機(jī)制缺乏了解。
為了克服檢測(cè)癌癥轉(zhuǎn)移的障礙,HelmholtzZentrumMünchen,慕尼黑路德維希馬克西米利安大學(xué)(LMU)和慕尼黑工業(yè)大學(xué)(TUM)的研究人員開發(fā)了一種新型的基于深度學(xué)習(xí)的算法DeepMACT(基于深度學(xué)習(xí)的轉(zhuǎn)移)清除組織中進(jìn)行分析)。DeepMACT甚至可以對(duì)最小的轉(zhuǎn)移進(jìn)行自動(dòng)檢測(cè)和可視化,還可以確定藥物是否已經(jīng)到達(dá)轉(zhuǎn)移。
基于圖像的AI算法
研究人員使用一種稱為vDISCO的組織清除方法來(lái)使整個(gè)小鼠身體透明。他們使用激光掃描顯微鏡對(duì)透明鼠標(biāo)進(jìn)行3D成像,從而可以觀察到最小的轉(zhuǎn)移灶,直至單個(gè)癌細(xì)胞。但是,手動(dòng)分析此類高分辨率圖像非常耗時(shí)。因此,DeepMACT誕生了(Cell10.1016 / j.cell.2019.11.013)。
DeepMACT使該團(tuán)隊(duì)能夠準(zhǔn)確地可視化候選藥物靶向哪些癌癥轉(zhuǎn)移以及錯(cuò)過了哪些癌癥轉(zhuǎn)移。他們的分析表明,基于抗體的藥物(例如,一種名為6A10的抗體,是目前可用的最有效的治療方法之一)可以錯(cuò)過受影響小鼠體內(nèi)多達(dá)23%的轉(zhuǎn)移。此外,研究小組還使用這種方法分析了肺癌,乳腺癌和胰腺癌的轉(zhuǎn)移擴(kuò)散,并觀察了轉(zhuǎn)移在不同時(shí)間點(diǎn)如何在體內(nèi)擴(kuò)散。
第一作者Chenchen Pan補(bǔ)充說(shuō):“ DeepMACT是實(shí)現(xiàn)全身轉(zhuǎn)移過程定量分析的第一種方法。
在檢測(cè)轉(zhuǎn)移灶時(shí),DeepMACT方法不僅與手動(dòng)檢測(cè)性能相匹配,而且分析速度提高了300倍。“只需單擊幾下,DeepMACT即可在不到一個(gè)小時(shí)的時(shí)間內(nèi)完成幾個(gè)月的手動(dòng)檢測(cè)工作,”TUM的博士研究生Oliver Schoppe說(shuō)。
由于DeepMACT可以公開獲得并且易于采用,因此科學(xué)家希望該技術(shù)將被其他從事各種腫瘤研究和治療選擇的實(shí)驗(yàn)室使用。如今,只有約5%的新藥候選者在癌癥治療方面取得了成功。DeepMACT在臨床前研究中的應(yīng)用可以改善對(duì)更好的臨床試驗(yàn)候選藥物的鑒定和開發(fā)。這種方法應(yīng)大大提高候選癌癥藥物的成功率,改善藥物開發(fā)過程,并可能挽救更多生命。